凝膠過濾層析（gel filtration chromatography）法又稱排阻層析或分子篩方法，主要是根據(jù)蛋白質(zhì)的大小和形狀，即蛋白質(zhì)的質(zhì)量進行分離和純化。層析柱中的填料是某些惰性的多孔網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)物質(zhì)，多是交聯(lián)的聚糖類物質(zhì)，使蛋白質(zhì)混合物中的物質(zhì)按分子大小的不同進行分離。
 
蛋白純化系統(tǒng)的實驗方法
蛋白質(zhì)的凝膠過濾分離
實驗材料 蛋白質(zhì)  
試劑、試劑盒 凝膠過濾緩沖液  
儀器、耗材 布氏漏斗 凝膠過濾層析柱 分光光度計
 
蛋白純化系統(tǒng)的實驗步驟
1.  如果凝膠過濾的介質(zhì)是干粉，則需在凝膠過濾緩沖液中完全溶脹。
2.  在遠離過往通道及直接光照的恒溫環(huán)境，將層折柱垂直安裝在穩(wěn)固的實驗室支架上。
3.  用一注射器將凝膠過濾緩沖液從柱子的輸出管注入柱子，至緩沖液達到柱子支持體平面之上，注射器留在輸出端以堵住柱子。
4.  沿著一根順柱子內(nèi)壁而放的玻璃棒將凝膠混懸物倒入柱子至所設(shè)高度，再小心往凝膠頂部加入1 cm 高的一層緩沖液，并連接緩沖液貯存容器，取去堵著柱子輸出管的注射器，用2~3倍柱床體積的緩沖液請洗柱子。
5.  流盡柱子凝膠頂部上面的緩沖液、關(guān)閉其輸出管。
6.  加入相當于柱床體積1%~5%的蛋白質(zhì)樣品。開放輸出管，讓樣品流進柱床，凝膠上面的柱子內(nèi)壁以緩沖液沖洗。
7.  在凝膠頂上用吸管加入1 cm 高的緩沖液層，重新與緩沖液貯存容器連接，開始洗脫。
8.  分部收集流出液。每分部相當于1%總柱床體積，分別測每個分部的A280，并各取小份樣品測生物活性，選出有活性的分部用SDS-PAGE檢測所含蛋白質(zhì)的數(shù)量和質(zhì)量，合并含目標蛋白的分部。
9.  用2~3個柱床體積的凝膠過濾緩沖液洗柱，柱子保存在含0.02%疊氮鈉的緩沖液中，柱于可無限次地使用。